色谱柱若使用不合适的色谱密封安全盖、密封垫将导致泄漏，使空气和其他污染物会通过色谱柱的密封处进入仪器，从而干扰色谱柱和检测器的性能。可能出现的现象有：
1.氧气渗入减小了信/噪比；
2.色谱柱氧化流失，柱效下降；
3.样品流失或引起的分解；
4.保留时间重复性变差。
为了获得zui佳性能，应在每次更换色谱柱后,或进行维护时更换密封配件。
1.色谱柱密封材料
色谱柱密封材料不同，允许使用的最高温度和柱类型也不同，目前常用的几种材质是：
(1)金属(铝、铜、不锈钢)，仅适用填充柱，最高温度可达450℃；
(2)Vespel(100%)，Vespel的成分是聚酰亚胺树脂，具有良好的耐热、耐磨耗和可塑性，连续使用耐热温度可达288℃，短时间内更可高达480℃而不产生明显的形变。适用填充柱和毛细管柱，安装方便、耐温可达280℃，但程序升温后，易失去密封性;若用于NPD，环聚物流失会干扰分析；
(3)石墨(100%)，用于各种毛细管柱，也可用于填充柱，耐温可达450℃、装取方便、可重复使用;不太适合MS和对氧敏感的检测器；
(4)Vespel(85%)/石墨(15%)的复合材料，适合于各种类型的色谱柱和检测器。耐高温(可达350℃)，装取方便，一般可重复使用，但要注意定时检漏；
(5)橡胶密封垫(含硅、氟、氯等)，耐温不会超过250℃，可用于各种柱型，通常用于玻璃填充柱密封。
2.色谱柱重新安装时,密封要注意
(1)安装位置(尺寸)要重现，否则引起峰灵敏度变化；
(2)安装时防止碎渣进入色谱柱引起峰形拖尾；
(3)不需要拧得太紧；
(4)使用清洁的密封垫，避免用手接触密封垫，以防手上的油脂污染；
(5)密封垫安装前，要仔细检查有无损伤，以防安装后，有问题时不易拆除；
(6)对那些不宜重复使用，如石墨密封垫，重新安装柱时要注意及时更换。